Tio år efter en världsomspännande serie apa-revolutioner och ett brutalt kärnvapenkrig bland människor måste Caesar skydda överlevande från båda arterna mot en lömsk människokult och en militant apfaktion.

I en futuristisk värld som har omfamnat apslaveri dyker Caesar, son till de avlidna simierna Cornelius och Zira, upp efter nästan tjugo år i gömsle undan myndigheterna och förbereder ett slavuppror mot mänskligheten.

Världen är chockad över uppdykandet av tre talande schimpanser, som anlände mystiskt i ett amerikanskt rymdskepp. De blir hyllade i samhället, men en man anser att de är ett hot mot mänskligheten.

Den enda överlevaren från en interplanetär räddningsmission söker efter den enda överlevaren från den tidigare expeditionen. Han upptäcker en planet styrd av apor och en underjordisk stad som drivs av telepatiska människor.

En liten stad i Kalifornien anfalls av marsmänniskor, vilket inleder en världsomspännande invasion.