Mortal Kombat är en urgammal turnering där krigare från Jordens rike strider mot krafterna från Outworld. Liu Kang och några utvalda kämpar kämpade och besegrade den mäktige trollkarlen Shang Tsung, deras seger skulle bevara freden på jorden i ytterligare en generation. Utspelar sig nu där den första filmen slutade, kämparna från Jordens rike lever en kort period av frid när onda krafter från en annan dimension kommer för att invadera och härja på jorden. De leds av Outworlds ledare, Shao Kahn och hans generaler såsom: Motaro, Rain, Ermac, Sheeva och Sindel. Nu måste Liu Kang, Raiden, Jax, Sonya och Kitana besegra Shao Kahn inom sex dagar innan Jordens rike sammansmälter med Outworld.

Baserat på det populära datorspelet med samma namn handlar "Mortal Kombat" om en urgammal turnering där de bästa av de bästa från olika världar kämpar mot varandra. Målet – tio segrar för att få laglig rätt att invadera den förlorande världen. Outworld har hittills samlat nio segrar mot Earthrealm, så det är upp till Lord Rayden och hans kämpar att stoppa Outworld från att nå den slutgiltiga segern...

Den unga Dorothy Gale och hennes hund Toto sveps bort av en tornado från deras farm i Kansas till det magiska landet Oz och ger sig ut på en resa tillsammans med tre nya vänner för att träffa trollkarlen, som kan skicka henne hem och uppfylla de andra...