Det har gått några år sedan Shinobikrigets slut. Naruto Uzumaki är Konohagakures sjunde Hokage i denna nya era. Hans son, Boruto Uzumaki, ska snart delta i Chûnin-examen tillsammans med Sarada Uchiha och den mystiske Mitsuki.

Mitsuki och Yuya blir styvsyster och styvbror på grund av sina föräldrars äktenskap. Mitsuki kommer inte överens med sin nya familj och Yuya vet inte hur han ska närma sig sin nya styvsyster. En dag blir Mitsuki besatt av...