År 1999 förstördes kärnkraftverket i Janjira på mysteriöst vis och de flesta ombord omkom, inklusive Joe Brodys kollega och hustru Sandra. År senare måste Joes son Ford, som är ammunitionsofficer i USA:s flotta, resa till Japan för att hjälpa sin frånvarande far som tvångsmässigt söker sanningen om händelsen. Under resans gång upptäcker far och son katastrofens hemliga orsak på vrakgrunden. Detta låter dem bevittna hur ett fruktansvärt hot mot hela mänskligheten vaknar till liv igen, ett hot som förvärras ytterligare av en andra hemlig återuppståndelse på annat håll. Inför denna katastrof kan världens enda hopp vara Godzilla, men utmaningen för Monsterkungen kommer att vara stor, även när mänskligheten kämpar för att förstå den destruktiva allierade de fått.

Matt Scudder är en före detta polis som nu är privatdetektiv. En knarklangare ber honom hitta männen som kidnappade hans fru. Det verkar som att de dödade henne trots att han betalat dem. Scudder vägrar. Men mannen går senare och träffar honom och berättar hur hans fru dödades. Scudder tar jobbet. Han gör lite research och tror att männen han letar efter har gjort detta mer än en gång. Och att alla de tog är kopplade till en knarklangare. Han var på väg att ge upp när de tar en annan flicka och Scudder försöker se till att hon returneras levande.