Nästan ett år efter sin astronautmors tragiska död börjar Alex och Hayley Woods på en elitinternatskola för framtida ledare, men börjar snart inse att allt inte är som det verkar.

Efter att ha rekryterats till en hemlig akademi upptäcker en grupp studenter att den magi de läste om som barn är mycket verklig – och farligare än de någonsin kunnat föreställa sig.

Följer tonåringen Clay Jensen i hans sökande efter sanningen bakom hans klasskamrat och förälskelse, Hannah, och hennes beslut att ta sitt liv.

En bipolär CIA-operatör blir övertygad om att en krigsfånge har vändts av al-Qaida och planerar att genomföra en terroristattack på amerikansk mark.